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Unique et inattendu en ce lieu hors du commun, la Citadelle abrite derrière ses murailles, le Muséum d’Histoire Naturelle de Besançon. Créé en 1943, installé à la Citadelle depuis 1959 à l’initiative du maire Jean Minjoz, considérablement enrichi depuis, le Muséum réunit nombre de collections naturalisées et surtout des collections variées d’insectes, de poissons, d’oiseaux et de mammifères présentés au sein de 4 espaces : un insectarium , un aquarium, un noctarium, et un jardin zoologique.
Nulle part ailleurs en France, il est possible de voir réunies sur un même lieu autant de variétés animales.
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