コムトワ美術館のコレクションは、ジャン・ガルネ修道院長の功績に負うところが大きい。スカンジナビアのモデルに触発された彼は、今世紀の大きな経済的・社会的変化の影響で失われつつあった世界を守るため、野外民族学に着手した。 1930年代以降、彼は自らの発案で、またフランス国立美術館や国立民衆芸術・伝統博物館の要請を受けて、コントワの生活の証となる品々を収集した。
1946年に設立され、1960年以来シタデルに所蔵されているコムトワ美術館は、個人からの多くの寄贈により、そのコレクションを充実させてきました。2007年には、ブザンソン市に膨大なネガ・コレクションを寄贈しました。
コレクションの一部はデジタル化され、ブザンソン市のウェブサイト「Mémoire vive」や人形劇ポータルサイトでオンライン公開されている。